大きな変更点

  • グラフィックが一新され、Switch2 版ではよりリアル寄りなグラフィックになっている。
  • イベントシーンではフルボイス化。
  • 説明不足だった部分のセリフが追加されている。
  • スマホアプリ「Nintendo Switch App」から利用できるゲーム連携サービス「ZELDA NOTES」に対応。
  • Rスティックでカメラ視点を操作可能。
  • プレイ内容を振り返ったり、次の目的地を見られる「時の軌跡」追加
  • 冒険を進めることで埋まっていく「タペストリー」追加。
  • オカリナ演奏で音声入力に対応。

細かな変更点

  • オートジャンプだったのがボタン操作（X）でジャンプ。
  • ボタンを押しっぱなしでダッシュができる。
  • ハイラル城下町ではカメラ固定だったのが、カメラ視線を操作することで見渡すことが可能。
  • 基本的にどこでも時間が経過する。
  • amiibo「こどもリンク」と「こどもゼルダ」をかざすことで、それぞれのお面がもらえる。
  • 最初から持っている財布には200ルピーまで入る（N64/3DS版では99ルピー）。
  • 水に潜った時に空気メーターが表示される（N64/3DS版ではカウントダウン式）。
  • ナビィのモンスター解説が詳しくなっている。
  • ツタをよじ登る時にジャンプして速く登れる。
  • 妖精のパチンコなど、ジャイロで照準を合わせられる。
  • 魔法メーターのデザイン変化（一定間隔でメーターが区切られている）。