| ボタン | 機能 |
|---|---|
| A | アクション / 決定 持ち上げる（ブレスレット） |
| B | 剣で攻撃 |
| X・Y | 割り当てたセレクトアイテムを使用 |
| 右スティック | マップ画面でズーム |
| 左スティック | キャラの移動 カーソルの移動 |
| 方向ボタン | マップ画面でフロア変更 |
| L / ZL | 走る（ペガサスの靴） |
| R / ZR | 盾を構える |
| + | アイテム画面の呼び出し |
| - | マップ画面の呼び出し |
| ボタン | 機能 |
|---|---|
| A・B | 割り当てたセレクトアイテムを使用 A＝決定・話す・調べる、B＝キャンセル |
| 十字キー | キャラの移動 カーソルの移動 |
| スタート | サブ画面の呼び出し |
| セレクト | マップ画面の呼び出し |
★ 3DS 用バーチャルコンソール版の操作方法は「VC 版 夢をみる島DX」のページを参照。
[+]ボタンを押した後、Rボタンでシステム画面に移動し、そこから「セーブ」を選ぶとセーブできます。
またゲームオーバーになった際にもセーブするか決められます（「リトライ」・「セーブして やめる」のどちらか選択可能）。
重要なアイテムを入手したり、イベントをクリアすると、通常セーブとは別枠で用意された「オートセーブ」用データに自動的にセーブされます。
A + B + スタート + セレクトボタンの同時押しでセーブできます。
ゲームオーバーになった際は「セーブしないで つづける」・「セーブして つづける」・「セーブして おわる」の3つの中から選べます。
[+]ボタンを押すことでアイテム画面を呼び出すことができます。
画面右側には、セレクトアイテムが表示されます。ここでX/Yボタンにアイテムを割り当てることができます。
左側には、所持しているホールドアイテムとセイレーンの楽器が表示されます。
スタートボタンを押すことで、サブ画面を呼び出すことが出来ます。
画面左側には、セレクトアイテムが表示されます。ここでA・Bボタンにアイテムを割り当てることができます。
右側には、所持しているホールドアイテムとセイレーンの楽器が表示されます。
ダンジョンの中では、サブ画面右半分でダンジョンアイテムとダンジョンマップの確認が出来ます。
[-]ボタンを押すことで、コホリント島のマップを呼び出すことができます。
マップには地名と重要施設（ダンジョン・店・電話ボックス）のアイコン、そしてプレイヤーの現在地が表示されます。
マップ画面では、Aボタンで「ピン」、Rスティックの上下でズーム、Yボタンで「地図だけ見る」、Xボタンで「おもいで」を表示できます。
「おもいで」では以下の項目を確認できます。
セレクトボタンを押すことで、コホリント島のマップを呼び出すことが出来ます。
プレイヤーの現在地が点滅する○印で表示されます。まだ訪れていない箇所は暗く表示、訪れた事のある場所の地名は確認する事が可能です。
またフクロウのメッセージ等も自動的に記録されます。
| ルピーの種類 | 価値 | リンクの感想 | |
|---|---|---|---|
| 緑ルピー | 1ルピー | - | |
| 青ルピー | 5ルピー | - | |
| 赤ルピー | 20ルピー | ちょっと うれしい | |
| 紫ルピー | 50ルピー | わりと うれしい | |
| 銀ルピー | 100ルピー | かなり うれしい | |
| 金ルピー | 200ルピー（GB/GBC） 300ルピー（Switch） | めっちゃ うれしい | |
各ルピーの色と入手時の感想は Switch 版のものです。
ルピーの最大所持額は：
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